为了明确不育的真正原因，男女双方都要进行检查，但对于男性的检查，相对简单方便一些。如果男性没有精子，那么对女性的检查和治疗就没有任何意义。对男性的检查，首先是对生殖器官是否存在发育异常的检查，由男性不育专科医生完成。
包皮
包皮是阴茎的一件保护性“贴身”外衣，如果不讲卫生，或者包皮过长，包茎，将会反复诱发炎症而影响生育。
阴囊
阴囊是睾丸的保护伞，可以保护睾丸免受外伤，还可以调节局部的温度。高温环境以及紧身内裤可以影响到阴囊的温度调节功能而诱发不育。
阴茎
阴茎是完成生育所需的性交活动中的一个主要工具，它提供精液排放的通道。引进的弯曲，纤维化，勃起功能障碍，阴茎癌等均会影响性活动而影响生育。
睾丸
睾丸是制造精子的“工厂”，一旦“工厂”出现异常（大小，质地及位置异常），精子的质与量就要降低，可以造成生精能力低下，甚至根本没有生精能力。有的人睾丸没有正常地下降到阴囊内，这事隐睾症，即睾丸隐藏在腹腔内或者在腹股沟管内，这些部位的温度比阴囊里边高，明显影响精子的发生和存货，并可以造成睾丸萎缩。先天性小睾丸症属于先天性疾病，睾丸没有发育，部分是属于遗传异常性病因，例如克氏综合征就是由于多了一条X染色体所致，是无法治疗的，患者难以恢复生育功能。睾丸除了可以产生精子外，还可以分泌雄性激素。小睾症患者除了因为生殖细胞的损害而不能产生精子外，同行同时合并严重的雄激素水平低下，伴有雄激素水平低下的一系列临床症状，例如第二性征不明显（胡须少，没有喉结，阴毛稀疏，生殖器官小等），疲乏，多汗，怕冷，心悸，性功能障碍，骨质疏松等。因此，适量补充雄激素可以改善患者的生活质量，例如促进男性第二性征发育，改善性功能，增进体力。此外，还要注意睾丸在阴囊内是否比较“安分守己”，如果睾丸的活动性太大了，容易出现“睾丸扭转”而导致睾丸的缺血性坏死，是一些人丧失了睾丸。
附睾
附睾是精子成熟和贮存精子的地方，如果有炎症存在，既影响精子的质量，又影响精子的存活。附睾的炎症又可以因纤维化形成硬结而造成附睾阻塞，使精子难以排出。
输精管
排精途径与附睾相连接的部分是输精管，如果输精管缺如或由慢性炎症形成结节，输精管就会被堵塞，精液不能通过，当然也不能将精子排出体外，因而也就不能使妻子自然受孕了。
精索静脉
是否有精索静脉曲张及其严重程度，对睾丸产生精子具有一定影响。精索静脉曲张与隐睾一样，可以造成睾丸的温度增高和萎缩。
前列腺和精囊
此项检查稍微麻烦一点，需要医生来完成。通过直肠肛诊指检，可以检查其大小，质地，触痛，并可以获取前列腺液进行化验检查，在触诊前列腺的两侧上外方时，可以触到精囊，并可感知其发育情况及病变。